微波爐蒸南瓜雖然沒有直接火上蒸鍋蒸出來的效果好，但是兩者的營養價值是差不多。微波爐蒸南瓜的營養價值同樣也很高，因為南瓜采取蒸的方式是最能保證其營養成分不流失的。俗話說“藥補不如食補”，近兩年，隨著國內外專家對蔬菜的進一步研究，發現南瓜不僅營養豐富，而且長期食用還具有保健和防病治病的功能。南瓜中含有豐富的胡蘿卜素和維生素C，可以健脾，預防胃炎，防治夜盲癥，護肝，使皮膚變得細嫩，并有中和致癌物質的作用。

除此之外，南瓜這一黃色果蔬中的維生素A和D特別豐富。維生素A能保護胃腸黏膜，防止胃炎、胃潰瘍等疾患發生；維生素D則有促進鈣、磷兩種礦物元素吸收的作用。所以適量吃蒸南瓜能收到壯骨強筋之功，對于兒童佝僂病、青少年近視、中老年骨質疏松癥等常見病有一定預防作用。

一般微波爐蒸南瓜采用的是老南瓜，相較嫩南瓜，老南瓜中鈣、鐵、胡蘿卜素含量較高。南瓜中還有一種“鈷”的成分，食用后有補血作用，清代名醫陳修園就曾說：“南瓜為補血之妙品”。蒸南瓜中的南瓜含有人體所需的多種氨基酸，其中賴氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、蘇氨酸等含量較高。蒸南瓜中的南瓜多糖，是一種非特異性免疫增強劑，能提高機體的免疫功能。