自閉癥的治療方法包括醫學上的治療、行為心理治療及特殊教育。如下：

（1）醫學上的治療：

1、預防性治療：防止自閉癥的出現，包括遺傳學上的輔導。

2、補救性治療：及早診斷，針對生理因素而加以治療。

3、癥狀性治療：藥物治療可以減輕征狀，例如過份活躍、不集中、情緒不穩定、暴力傾向、睡眠困難等，但效果有限。

（2）行為心理治療及特殊教育：

1、一個一致的治療計劃。

2、盡量令自閉癥兒童能明白對他的要求，令他對環境產生興趣，覺得參予有意義。

3、要制造一個穩定、一致的治療結構，與及要主動的幫助他們參予。

4、教他的東西要適合他的能力，盡量幫助家長去學習在家里用同樣的方法教導他。

5、教他學習正常行為去代替異常行為。

6、盡量用鼓勵的方法，開始時可能需要物質獎勵，最重要是令他參予后得到成功感。成功的經驗會令他的情緒穩定及有更大的動機去參予。

7、要從多方面去評估他的能力。他的能力是參差不齊的。根據評估結果去提供適合他能力的訓練方法及學習機會。

8、重復性行為及不愿改變的傾向需要慢慢治療。通常是幫助他學習其它較好的行為去代替這些行為。另外，他們愈明白得多，這些行為就會愈少。

9、用行為心理治療方法去應付一些困難行為，例如發脾氣、不愿吃飯等。

10、盡量令兒童和家長有愉快的生活經驗。