治療急性再生障礙性貧血的治療主要是西藥治療。多采用免疫抑制劑、造血刺激因子、免疫球蛋白等方法綜合治療，費用比較高，治療比較困難，而且免疫抑制存在較大的副作用。免疫抑制治療包括抗淋巴細胞球蛋白（ALG）、抗胸腺細胞球蛋白（ATG），環孢菌素A（CSA）兩種。

抗淋巴細胞球蛋白（ALG）、抗胸腺細胞球蛋白（ATG）具有針對免疫活性T抑制細胞介導免疫的功能，它們能誘發T細胞增殖，使造血恢復。環孢菌素A（CSA）是一種Ts細胞Tc細胞克隆的殺傷劑，糾正再障患者的免疫紊亂，促使重癥再障的骨髓造血功能恢復。另外一種治療重型急性再生障礙性貧血的方法是骨髓移植。但是骨髓移植不易找到HLA組織配型相近的供髓者，而且花費較大。西醫應用造血刺激因子的幫助，對重癥再障患者仍不能恢復其衰竭的骨髓造血功能時，創造條件實行骨髓移植，但各種原因限制了臨床應用，所以重型再生障礙性貧血的死亡率會比較高。